生物质锅炉的燃料种类非常丰富，主要来源于农业、林业及加工行业的废弃物。常见的固体燃料包括：农作物秸秆（如玉米秆、小麦秆、稻草）、林业剩余物（如木屑、树皮、树枝、锯末）、农产品加工副产品（如稻壳、花生壳、棕榈壳、甘蔗渣）以及菌棒废料。此外，经过压缩成型的生物质颗粒燃料也是主流选择，它将松散的生物质原料制成高密度的颗粒，便于运输和自动化进料。液体生物质燃料（如生物柴油）和气体生物质燃料（如沼气）虽然也存在，但在常规生物质锅炉中应用较少，主要用于特定类型的燃烧设备。这些燃料的共同特点是可再生、分布广泛且成本相对低廉，能够有效实现变废为宝。